都说有利就有弊，世间万物是矛盾的综合体，卵磷脂既然有着以上诸多功效，必然就会有这副作用。卵磷脂的副作用主要有以下这些：
1、卵磷脂的主要副作用是过敏，因此有过敏史的患者建议不用使用卵磷脂。
2、卵磷脂中的胆碱对脂肪有亲和力，但是若体内胆碱不足，则会影响脂肪代谢，造成脂肪在肝内积聚，形成脂肪肝甚至会发炎肿胀。
3、卵磷脂是脑组织重要的构成物质之一。大脑的思维活动是通过脑神经细胞之间的特定联系完成的，这种特定联系以乙酰胆碱为基础。如果缺少乙酰胆碱，这种联系就会减弱，大脑将会出现思维能力减退、记忆力下降，甚至丧失记忆等严重问题。
4、不恰当地服用卵磷脂不仅不会发挥卵磷脂的功效，还会引起相关的副作用，因此必须按照说明方法来正确服用。
